Their numbers must have been above a certain
level.

他们（某个种族，现象之类）（的数量）肯定曾经保持在一定数量级之上。（的数量可以省略，口语自然一些）。
听起来像是生态学或者海洋生态学的文章里经常用的句子。
我不同意上面两个答案。
must表推测而不是表要求，have been above是表曾经到达并保持一定数量水平之上。前面两个答案的意思在英文里是
第一个Their numbers must be (kept) above a certain level.
第二个Their numbers must reach a certain level.
都忽略了时态的问题。如果上下文是研究过去的某种现象，那么我的翻译是正确的。